تعداد اسلایدهای پاورپوینت: 31 اسلاید در این پاور به بررسی الگوریتم UPGMA و الگوریتم Neighbor joining پرداخته ایم

ahmad

صفحه 1:
Wit Ly Neigt joining ا ل

صفحه 2:
1

صفحه 3:
یکی از روش های ساده ای است که بر مبنای توده کردن داده ها و با خوشه بندى سلسه مراتبى براى ساخت درخت فيلوزنيك در بيوانفورماتيك به كار مى رود. الكوريتم: فاصله بين دو داده را از روى ماتريس فاصله بررسى مى كندو درختى كه مى سازد درخت ريشه دار است. در هركام دو خوشه نزديك به يكديكّر باهم تركيب شده ل درسطح بالاتر را میسازند.

صفحه 4:
۱ ply» A,B ouig> gs yw obLold CRUE IC ‏ا ا ا‎ nee SBR ‏ا ا‎ ed ‏خوشه مى باشد:‎

صفحه 5:
فرض كنيم كه ينج عنصر داريم(©,3,2,©,0) وماتريس زير به نام 01(] فاصله بين دوبه دو عناصراست. D; (a,b) = 17

صفحه 6:
ال ۳۱ ۱ فرض كنيم كرهى كه , 3 را به هم متصل ميكند لا بناميم.

صفحه 7:

صفحه 8:
تا

صفحه 9:
Re PCKeCNS P<od SOREN (CH) ESTOS Tee Se 5(a,v) = 5(b, v) = d{e,v) = 22/2 = 11 i(u, 0} = dle,v) ~ d{o,u) = d(e,o} - 4(b,u) = 11-85 =2,

صفحه 10:
(0,b),€},c} = (Dy((a,b),c) x 2+ Dy(eyc) x 1)/(2-+ 1) = (25.5 x 2439 x 1)/3 = 30 Dade} d= (Dydd) x2+Dyle) x1} (2+1)= (805 x2+49x1) 1 =16

صفحه 11:
گام سوم:

صفحه 12:
فرض کنید گرهی که 0, را به هم متصل میکند ۷ بنامیم. 6(c,w) = 6(d, w) = 28/2 = 14 Died (a) = (Ox (ad) 1+) gh) 11+1)= (A148 De

صفحه 13:
گام آخر: ‎oS 08‏ ا ل ۱ ((a,b),e) ‏(۵,ع)‎ ((a,b),e) 60

صفحه 14:
دنوگرام ۱۱۳6۱۸۸ : ۵)6,۳( - ۵)0,۳( > 0),

صفحه 15:
۱211010

صفحه 16:
در بیوانفورماتیک. [۲ یک روش خوشه ای برای ایجاد 1 Awe ‏ا‎ Ben -Cr) ‏يروتئين است استفاده ميشود.‎ الگوریتم نیاز به آگاهی از فاصله بین هرجفت از گونه به شکل درخت دارد. زم به 30۳ 00100 ى 9 ۱ ۳ ۳

صفحه 17:

صفحه 18:
ی ([,01 فاصله بین دو جفت آو [ است.

صفحه 19:
محاسبهوى ماتريس : © ([,0)1 فاصله بين دو جفت أو[ است. (6)1,.10-(0)1.8-(0,ع)5

صفحه 20:
فاصله كونه هاى ديكّر از كّره جديد: d(u,k)=12[d(f,k)+d(g,k)-d(f,g)] لا گره جدیدو ! گرهی‌اسنکه فاصله آترا میخواهیم ‎OS Be‏ 7 1۹

صفحه 21:

صفحه 22:
کنید يس ۳۹9 نام فاصله زیر به ۳ ماترب ‎b‏ 0 0 ‎,b,c,d‏ ‎oi‏ ۳ گونه(», ‏فر ‏داریم: ‎

صفحه 23:
سيك

صفحه 24:
6(b,u)=d(a,b)-6(a,u)=5-2=3

صفحه 25:
به روز رسانی ماتریس فاصله نخست: d(a,e)+d(b,e)-d(a,b)]

صفحه 26:
fa DUN EY C RB TTE RY CAT e fee)

صفحه 27:
00 پیوستگی دوم:

صفحه 28:
برآورد طول شاخه دوم: u,v

صفحه 29:
ماتریس فاصله ی بروز شده دوم:

صفحه 30:

صفحه 31:
- - (,۷) فلت (۵-2) 12 +(۵ 0 20 ند 5 242+ 0-72-72 8(w.d)=d(v,d)-8(v,w)=4 (w,e)=d(v,e)-8(v.w)

جهت مطالعه ادامه متن، فایل را دریافت نمایید.
10,000 تومان