جستجو در پایگاه اطلاعاتی ncbi

صفحه 1:
با نام و ياد خدا جلسه دوم درس بیوانفورماتیک 

صفحه 2:
جستجو در پایگاه اطلاعاتی ‎NCBI‏ 

صفحه 3:
|) TD wetcome te newt Prt ‏سیخ‎ 2 eee ‏تست‎ ی و هی موی موه که لها رامق تسه ما Learn 9 Research ‎and‏ هامید ‎4 ‎ones! an prone women ‏و‎ ‎‘submit Download ‏موی دی سوه‎ Taner ato yee nonce ‏یت‎ compet ‎ ‎Develop Analyze | Soars ack ‎J ‏اس‎ ‎ ‎ ‎ 

صفحه 4:
نامع مامد مس سوه east Neeson cane ة عر ۳ عا د ويه Lean bias oreaten ona 6 Research ipl NC eset nd 4 Download 4 a Analyze lest an NCB td your ssa sk جوز ‘ost n NCB | Minin | Orrin | NEL Nous ‎Welcome to NCBI‏ اا سعد ‎Resoures Uist (AZ) “The Nail Cataracts Infommson ances sina hth hy proving ‏ممع عمد‎ ‘Resouces ‎ ‎Dan Soha mums << submit ‏سس‎ Onn a act ae ‏سس ات‎ ‎nats & Meine ‎ ‎ ‎ ‏تام ‎‘Sequence Aras‏ | سس سسا ف وام ‎ ‎ ‎ ‎ ‎1 3 Be ‎ ‎ ‎ 

صفحه 5:
eset ‏یم‎ Sa ONA&RNA assent ‘Aaatosee pos iematen on ‏المحم ممعم امنا ممم عه‎ names andor meta ‘ltrs tematy Genes Prfe ‏واه سرا عیام فد مس اعوسات‎ otha ing tac The ‏ممت‎ ‎۳ sberver poder sector to eedaets tha re ten Sk \Stedabelonconsce sna rate mre sims stated aie ese eae ‘Same The BeSanpledaatae crane deerzane beled saxte mae wed ‏تعمد لاعن صرت‎ ۳ تمه ره يا موه 0 0000 هم ‎sorta,‏ (itso const Semen Tose AEST) ‏مرک هه طلست تنم‎ hr orgie rc of <ONA (rence squrces REST cate sorted (est Crag te Reece EST ashes | Sires Sens 438 Aref are sg Md fe DA 83 on eid ty ch ‘abs of sat Gens Vii fh NP) ۱ ny era ein eos Ne cote Ma ae مس سید ‎Cees‏ ‏وود سح tse سس Sensree Anas Tora & Tile 

صفحه 6:
e SNCBI = ‏یی‎ 00 ‏سام‎ | Soon rere ‏عون‎ ace ume ‏هساسسس‎ | EST, ‏9ه هم هم سم دا‎ Soret ‏مهس سید سس بر‎ ota Chana tains | ‏محر‎ ore ee as ess 5 Joviing internaten an the structure of assembles gonomes, assembly names and other meta-data, ‏لحب‎ ‎۸ ‏ات‎ [pts, and Inks to genome: sequence dita, 3 | ‏ی‎ rose tien 35395 ‘Genes & Expression Mes Tosnarncs, funchonal genomics. and genetics studs and links to the resulting datasets Ths source ReRe0Gene ‏و‎ orto ett ‏سمه سم | لا‎ ‏ا م ا م‎ ‏سس‎ | | on dba = ena oan in visa we x sears cane cnr ted ose win xen ai es soe a as cert Bt ‏و‎ [Rede et larly ca sete man and nie pnd rela tts ted | Gas seh ۳ ‏مت‎ curt ae ‏ون‎ ۵ (astra Senne Tn QED ta Lecce ven | Gey re ‏مس هت سس‎ (sess cs Sy Senne 88 Geran oth echt cris tlre pte weme OAA ‏سس سس تفع‎ gh FAL ‘ton 

صفحه 7:
* برای مشاهده تعداد موارد یافت شده در مورد ژن مورد نظر در هر دیتابیس , کلمه 0۵۲۵0356 ۸۱۱ را انتخاب می اما ee ۱۳:۵۱ (aout specs CipaySetrgs = Surmay 20 por page, Sere by Default or Sendo» Fillers: Manage sina coor مب اجه سف 

صفحه 8:
* صفحه ای باز می شود که در آن نام دیتاییس ها تعریف هرکدام و تعداد موارد یافت شده در مورد ژن مورد نظر در أن ديتابيس را نشان می دهد. hat ‏سوه‎ سوت میس Genes Resuts found in 31 databases for "GIB? sowie racer ee (ined eters. dren stg mets erature 

صفحه 9:
جستجوی یک توالی نوکلئوتیدی بر كاضر سنجو مقايل كلم 6 نام ژن مورد نظر را وارد می الك ث6 DNA & RNA. 

صفحه 10:
Nucleotide 2-1 --- 5 اك مر ‎ae‏ و پچ و ی دج ‎‘See @JB2 gap unchon proten beta 2. 26kDain the Gene database ‘Results by taxon‏ 5 ‎eno ea aaa as‏ ‎ane conte‏ ‎eee‏ ما | 0028[ ۳ ‎‘Source database‏ ‎uw Sa‏ ساس ف ‎hanasu) Esra Oe‏ ب حم سسا ‎Customize. G_ Symtnetic construct Homo sapiens clone crsbSraaden_D6277 GJB2 gene encodes complete ee‏ ۲ ‏تن‎ ‘GenBach FASTA Granbics 0 + ero ‏هلاه منود 2 وم اس‎ ‘Sn ass canes sera Felt] © Ralus nonsaius gap junction poten. ela 2 (Gib). RNA 3. 2.448 np near mRNA ‘Mus muses gan uncon pen peta 2 (@ipg) mRNA 2404 bp meal mRNA | Recent actity ‏للقي‎ EAST Gusti “8 vomo sais ga hein bein? pth 0480 mA comes ‏موه و‎ | ‏سس مسج و‎ ‏اي و‎ raat ey ا era 

صفحه 11:
* می توان با اعمال فیلتر ها جستجو را محدود کرد ( بر اساس گونه نوع مولكول نوع بايكاه داده تاريخ ثبت و ...) مس و 

صفحه 12:
* پایگاه داده 86۵/560 مجموعه توالی های استخراج شده از ‎GenBank‏ ‏است که تصحیح شده و غیر تکراری هستند. یعنی بر خلاف 6608۵01 در پایگاه داده 86۵۲560 هر رکورد مربوط به یک ژن يا فرم پیرایش شده از یک ژن می باشد. * با انتخاب نوع ارگانیسم توالی های انسانی را انتخاب می کنیم (منو ت راست). هته عع" صم ‎Nucleotide‏ سس دید تايس قد امه موی 

صفحه 13:
1116 8675660 ۸66۹5۱0۱ 5 human mouse Curated Protein fae fruit fly zebrafish Arabidopsis Predicted Protein (human, mouse) Chromosome (Microbial, Viral, Arabidopsis ) Interim Identifier for Microbial Chromosomes mRNAs and Proteins NM_123456 NP_123456 NR_123456 XM_123456 XP_123456 XR_123456 Gene Records NG_ 123456 Assemblies NT_ 123456 NW_123456 Nc_ 123456 NR_ 123456 

صفحه 14:
اسر _ دوس ‎er‏ نو Ja ried] 0 see feel wa rege a) ‘ena = Sunny. Spa Sty ta rte 5-19 10 ‏سای‎ Reg Dat ] ‏ننجت تمتها‎ SSL Home sapns cx cen psn nes 74086462 MOA ۱ ‏مه سود موه‎ as een LHL Ca ۳ 7 on aunesane S 2 ‏هو‎ ‎Gam BT Gates ‘SREDICTED. Momo sins ap unann en bi 8G Harb. ae 2:25 0p tee reo, been a aN TET eee A anes 

صفحه 15:
Send to's 12 Create alent’ Aavanced Dispay Setings: + Summary, af pA\nage, Sete by Detail order Items: 20 @ Fiteresotvated RefSea, Clara) © Found 22 nucleaide sequences. Nucleotide (20) EST (1) GSS (}) 8 1 2,347 pp near mRNA Accession: NM_0040048 ct: 195590220 ‏وفع هکت رنه‎ 8 tion protein bata 9 2 12.513 pp near DNA Peceesion: NG_O0E358.1 Gi: 108115124 fsokany EASIA Granies [Nucleotide | (gjo2) AND "Homo sapiens"[poran:__beid9606] | ‘Species ‘imate 20 ‏یه‎ Molecule rps ‘eromic DNARNA ‏إق‎ ‎MRNA (15) ‏ا‎ 00 Customize Sequence length Custom range Rotaso date 01 

صفحه 16:
* در زیر کادر جستجو, کلید ۸0۷۵۳660 را انتخاب کنید . کادری باز می شود که در آن می توان چند کلید واژه را نوشت و با کلمات ‎orl and‏ و یا ]۱0 به هم ربط داد. درضمن میتوان از پنجره ‎Sb‏ ‏مربوطه فیلد مورد نظر را انتخاب نمود. مثلا این که کلید واژه مربوطه نام ژن , نام ارگانیسم , نام پروتئین آن و ... باشد. مكمه !الا سوسس مستي مما اط اتا ۳ 

صفحه 17:
* با انتخاب 5611109 015012۷ می توان فرمت نمایش, تعداد رموردها در هر صفحه و نحوه دسته بندی را تنظیم کرد. Nucleotide “Musleotoe ligt) AND Home sapien porary ‏3م‎ ‏ا‎ Species eS Display Sottings * Summary. 20 pe page. Sore by Defaul ord Sondio = sas = 1 a tums pr page Sort by ۰ | Summary 5 eau er 1 oc ‏مسرت 9 پیت صو‎ 1 | ۳ ‏وده‎ Date ios mRNA ‏مه‎ a ate teased ۱ ‏مد‎ © FASTA toa) 0 Cri Name 4 ‏متسس سد‎ sew | ASN 20 Taxon 10 1 4 RetSea Revision ely نان Sequence eng ooh custom ange + ۱ Release cite 212.519 pp mear ONA stom ange secession NG_OTG368 1h 166118124 ‏مت‎ ‎Revision te ‏و‎ © PaepcreD: ۲ ction ona 5 san maa 2 ‏قمعم‎ ‎2.325 bp ear m=NA 

صفحه 18:
ذخیره کردن اطلاعات نتخابى بس از انتخاب ايتم مود * همجنين براى ذخيره فايل هاى نظر , در ب ‎to‏ 5600 با انتخاب كزينه 216 و همچنین تعیین نوع فرمت (مثلا فرمت ۳۸۵5۲۵۸ ( ‎“create file als‏ را زده تا اطلاعاگ مورد نظر را ذخیره کند. sane 

صفحه 19:
* يس از محدود کردن جستجو ویافتن توالی مورد نظر , صفحه مورد نظر را باز می کنیم. ‎toms: 20‏ ‎O Fie seat Reg Ces‏ ت یو ‎ ‎Case O Fount 22 met ‏رهق تما سوه‎ ESTs} G88 1) ‎Click ‎ 

صفحه 20:
اطلاعات مربوط به توالی نوکلئوتیدی دارای سه بخش است: سرآمد ‎(Header)‏ ‏ویژگی ‎lai (Feature)‏ : Joli (Header) ‏بخش سرآمد‎ -1 - 5لا06ا : یک هویت منحصر به فرد پایگاه داده برای مکان توالی در پایگاه داده ( نه کروموزوم) است. پس از آن طول توالی , نوع مولکول و سپس تاریخ عمومی شدن رکورد ‎DEFINITION -‏ : که اطلاعات خلاصه ای ازتوالی شامل نام ورده بندی منشا ارگانیسم به دست می دهد. ‏- : ۸55۱۵۷ شماره دسترسی است که یک عدد منحصر بفرد است , بین پایگاه داده ها مشترک است ودرمقالات به آن ارجاع داده من شود. فرمت آن: دو حرف و پنج رقم است ویا یک حرف و شش رقم ‏- !۷۶۴5۱۵ : عدد شماره نسخه (0۷۳۱۵6۲ ۷6۲5۱۵۲) و ‎gene index) uj ala‏ ۲ . این اعداد مربوط به نسخه فعلی است و اگر شرح توالی بعدا بازنویسی شود عدد دسترسی ثابت می ماند اما عدد نسخه افزایش می یابد. ‏- 086۸۱۷۱5۱ : شامل منشا ارگانیسم با نام علمی گونه و طبقه بندی تاکسونومی 

صفحه 21:
بخش سرآمد (۲۱۵۵06۲) Homo sapiens gap junction protein, beta 2, 26kDa (GJB2), RefSeqGene on chromosome 13 NCBI Reference Sequence: NG_008358.1 FASTA Gropnce Goto 7 ‎FRI O3-SEE-2018‏ مد هه ‎bp‏ 12513 ومد ‎DEFINITION Horo sapiens gep junction protesn, beta 2, 26EDe (QIB2), Ref: fon chronasone 13. ‎ ‎ ‎ ‎ ‎۱ crvasexasize ‏وه مس موه‎ SOURCE Huo sapiens Ian) ‎ORTAMISH Hone sapsens Eukaryova: Mevazos; Chordata; Craniasa; Yeruebrava: Fuseleossonls Cetarenini; Hominadae: Hana ‎nerenencr 2 (eaea 1 co 12513) ‎AUTHORS Baux,D., FaugereyY., Larrieu,L., Le Guedard-Hereuze,S., Hanzoun,Dey THTE —-MD-Ustmases: a comprehensive get Cf davabasce vd record and ‎Usner syncrone causing genes ‎ ‎ ‎ ‎ ‎ ‎ ‎ 

صفحه 22:
2- بخش ویژگی ‎:(Feature)‏ شامل اطلاعات بط به ژن , منا > 5 يصيات که تا ی ی ‎ea‏ .قيق رن و خصوصي زیستی - 50۱1۲66۵ : طول‌توالی, نام علمی‌ارگانیسم ,عدد مشخصه رده بندعرا نشان می‌دهد. - 9606 : اطلاعاتی در باره توالی کدکننده و نام آن را می دهد. - 605 : برای ورودی های 0۸1۸ وجود دارد که ه نواحی از 0۸۱۸ که به اسیدهای مینه ترجمه شده اند را می دهد. شروع این نقطه در توالی با ۵۳6۵ است" ‎oS cowl CDC 5] 4, translation/-‏ توالی پروتثین را نشان می دهد. ‎misc feature oly als +‏ که بعد از بخش 005 وجود دارد به مناطقی شامل ساختارهای ساقه - حلقه , تواحن ترانس ممبران وی ساختارهای تگزاری, ابثارة مق کید ‎STS (Sequence Tag Site) >‏ : عبایتاستاز ناحیه کوچکیاز 0۱۷۸ به طول200-300جفتبا ارتاستاز از از که توالیدقیق‌آن‌در هیچ جاعدیگر ژنوم وجود ندارد 

صفحه 23:
بخش ویژگی ‎(Feature)‏ 

صفحه 24:
۳ (Ygene_eynonsa-"CX26; DEVAS; DENRGR) DENBL; DENBIAr EID; aD, 38017 PER" fmoten"connexin 26; gap junction protein beta 2" /codon_stert=2 ‘fpreauct="gap Junction beca-2 provein” كلعج مور / ‏لسع هه‎ | GHINLTVEFIFRINILVVAAREYH 0 [XRKF IKGE INSE FADIEE IAT QHVRIFGSLWNTYTSS1FERUTFEAAPIYY=YVIONDS _FS4gRL VACNAN2CPNTVDCEVSRPTEKTVFIVEMIAVSGICILLSVIELCYLEIRYC 276.338, "عمدو ی ‎KID: NSRDI: PEK"‏ /Anference="non-experinental evidence, no additional aevails recorded” (nove="propagated Trom UniProtKS/Suise-Prot (F28033.5) ceanmenprane region" 442. .509, mage ‏معدم‎ 

صفحه 25:
3- بخش توالی : ابن بخش با 08۱6۱۲ شروع می شود و توالی 0۱۱۸ را نشان می دهد که با علامت // خاتمه می ‎Ub‏ 

صفحه 26:
۱ ۱ 181 622000۵09 6۵9۵66۵۵0 cgcccagegt agaagataga ttgggccacg ctgcagacca 301 teactetceg cactatgate ctcgecatag ctecassgg ggzetagaga gatcagcagg 421 teeecatere ceacatocgg ctatagacee tecagctear ctrestaree acgecaacae 421 ceccagtage cavgeacuta gectaccuga gacacgevas 922959956 20222 661 cotceatgza cgzetterat gteatatace accucttess catucagcac ccaateaact 721 geaacgeeta gecttgscce aacaccateg actgctttas gtcccagese acggagaaga 241 aarcgtgtca tecgetaatt agataccgtt ctgggaagre aaaaaageca grttaacgce 962 cetateaags creagtegct agcatttcce ascacaaaga ttccgacctt aaatgeaace ae6) aarcecacta acecautace scrcsatuag gagvacasea cousgcagae gasogaseag 31921 tecctgtegt casaaacaga tesagaaage coggactcta aagsctgttg actaaagetg 2992 29622۳905 actteaaaag tergtttgct raccesttea gecrccaatt tottaatoa 2041 eaacatagct aataacatgs gaaaagaate gangccaagg tetagataaa tattgagces 2161 gtactceace catttcagts agggtaagta cottectgt> gteaagaata goattgeaca 2281 aacgvatoaa acacacttaa sacattaaaa cataaccte: ataataasct aasaaaaaaa “ 

صفحه 27:
*با کلیک روی کلمه 6*0۳ , اگزون موردنظر در ‎wo cuba Wei‏ شود ‘gap junction protein, bets 2, 26kba" 904024 و 7ع سر جوز | /product= 5001. .519: /gene~"G352" /gene_synonyn="CX28; OFNA3; OFWABA; DFNBL; DFNBIA; KID; ‏رمو‎ NSROL; PPK" ‘alignment :Splign:2.0.8" DFNAS; OFNASA; DFNDL; DFNBLA; HZDs 

صفحه 28:
ttcacceggg gegcectege ceaageggec agctctgagg geacteccce gececetege eeeeeccecc ccgggeaagt geggaaaacg geggtactct accgaaagct ecaggaacte teegcezagt aaatttcast cegceceege gegagactca atcgegecct ggecccegea tecgtaactt ee 386268 16862266 cggttgccce ECCEEEEEEC sateezeces ECECECEEE® atgtecctte tttteaatte agccttcect eecagagatt cgactctcag gegtaacceg geactaggag gegegttcec Ser ere ee agacccagag acgtecttes ccggagctes gegecceegc getetcecce ccaccaaacg ‘teaagcages aaaatccceg ccesecctac tesegestec gcgecectcg gegctcaaag 88882058 0 ggaccaacac cegcceagct gzeteczagt ceagetttat teacccactg gtttceccee cttctgcage eccazccaat cgccgcttce ectgegegeg gaectcateg cegggctttc cegececgct 386666 as cecectt ‘tEECECEEEE ccegezeect ggcgtttctg gcaccgcccg accgccagcg cctggctact gceaagctcc cttegeeces cteaceceoa تست ‎ccgccaageg‏ ‎gecacttegs‏ ‎‘ttgggegett‏ ‎acccagaggc‏ gccaggaace 1 ‏تس تا‎ geaceceate ececegecee agcecagcce tagettceas acctttacct ttecctazas 4681 4741 4301 4361 4921 4981 5041 5101 5161 ,5221 5281 5341 5401 5461 5521 5581 مود 5701 

صفحه 29:
Homo sapiens gap junction protein, beta 2, 26kDa (GJB2), Ref: chromosome 13 NCBI Reference Sequence. NG_008258.1 ASTA Graphiee Locus ‏ال‎ 22513 bp DNAs linear PRI 03-SEP-2013 peFiuition ‏مسهظة‎ sapiens gap junction protein, beta 2, 2ékDa (G7B2), RefSeqGene of chromosone 13. ACCESSION 168 VERSION 16_008355.13 KEYWORDS RefSeq; Refseqsene. ‘SOURCE Hono sapiens (human) ‘ORGINISM Honc sapiens Eukaryota; Metazoa: Chordata; Craniata: Vertebrata: Futelesstoni: Menmalia: Eutheria: Fuarchontoglires: Primates: Haplorrhini: Catarrnini; Hominidee; Homo. REFERENCE 1 (bases i to 12533) 

صفحه 30:
Homo sapiens gap junction protein, beta 2, 26kDa (GJB2), RefS م2 chromosome 13 NCBI Reference Sequence: NG_008368.1 GenBank Graphics >gi|196115124| ref [NG_008358.1| Homo sapiens gap junction (GJB2}, RefSeqGene on chromosome 13 CACTGTGAACTTAACGCACAGCAGACCT GGGGCTGCTCTIAAGGCCCTGCIGICTCTCCTCTTAGTAACA ACACCATTICACAT GAAGT GACAGI GGTAT CIT 11ST SCCCIGGARATGGAATACAACAATGSCITICC RACTITICTGTGGCAGAGACCTACAGACAGAAGTACATTTTACACTGGATCCAGGACACACATCAGTCTS RAAACACACACAT GRACCAAACGTTCCTAAAGCATTACTTATCCTI GCTRATAGCAACACATICTCATA, ‘TICTETTATACTICATTIAATTICATATAAAAAAGABAAGGAAAGGAAAGBAATCTATTICICAGCCCAT ‘TAATAAGGTCAGGAGCAGCAACACCAGACTAGAAGAAAAGCTIACCTATAGAITITICTGCCACCTCTTS AGTGCGTCCAGCTTICCGACAAGTCTCAGTGCCATCTACTGTGCGCT CTGGGTATTGCAATIGCITTITT ‘TIT TETITTTITTTTTTITTTAGAATGAGACTAAGT CASRGAACACAAAGRACTICITTCCCCACAGIGS ‘AGATGSCT CTGRAAGCGTTTAAGGARTAGCTTAGAT GASTGGCTAACACATICTCCCGGTICTSRATICT AAGACCACAGACTCCATGTCCAGTCCCCAAAGAGASGCTT GCAAGCTACRGARTACCCCTCTERCTEGG ACCTCAGGAGCTAAACTGACCACGTRATIGSTT CTAGAAAGT GAAACGITITAATTIGAAACATCCARAT GASCATTTTGTGAARAGCTACTGCCGTCCAT CAAATACARCACAGCCAGSGASTCATCGCTCTATTGCCC ‘TTGICAATCCTACATCTATAGTTIT TTT TGCTACAGCASTTCATGAGTGTIGACTCTATICTAACTTGIT (CCAGAAGCCCTICARGATGATAGATAGCACAATATITITGTAGCCAGAGCIASAATGIAGAGCICITITI GGCTICCT7GTGAATGATCCAGRATITCCATGTTGSCAAGCCACCATAATITACAGAATITACTIITIAT ‘ATT CATA GAAGTARAAMAAATTTACCTATTTAAGGAGT TATAGCTCTGSRITCATITCTGACCRAAATS ‘IGCTITTTGACACARATACAATIGSRAATGICTTTGTAATITATCCACASICTGCCTAGATAATCATARA bein, beta 2, 

صفحه 31:
FASTA Format >gi|603218 | gb|U18238.1|MSU18238 Medicago sativa glucose-6-phosphate dehyd ‘CCACCAGATATAATTAAGTAGATCAGAGTAGAAGAAGATGGGAACAAATGAATGGCATGTAGAAAGAAGA TACCATACCTACTCAATCTC CTT ST ACTICABACTCCCACACTCTCTATICITCIO£ FASTA Definition Line ‏ل‎ 1 1|MSU18238 AGATAGTATTTAGAt AGATATCATTCCAAI CCTGAGCACATTCGI TICTTGGACAATAT! AACTACTATTCTGCt CTAAATTCTAGGAAt AGCAAGGGAGAAACt GCAACCTGGACTGGI ATAACCATTCCAGAt Database Identifiers gb GenBank emb EMBL dbjDDB) sp SWISS-PROT pdb Protein Databank Accession number TTCAAACACCCCGACTTTTGC -ATTGTGAAAGCAGGGAAGGCC |GTGACATTTTCAGGAGTAAAA TTACATGAAGCTTACGGTCAA TATGGGCAACGATATCAAGGG (0 ‏شق مق‎ 1111611 GCAGAGACGAATTA pir PIR. \CAAAATTGATAGAGGGGAGTT GAAGCCGGTTCCTT) rg PRE GAGTTATTAGAAAAAGCTGGA |ACCAAATTTCATAATAAAACA |AAATTTTCGTTATAATCTCTC 'GTGTAATAGATTTGGCTCTGA TATGTTCAAACACC AGGATTAGGATTAT! TCATTTTGGGGTGTA ATGAAAATARACGGGAATTGTTTCTTTTTGTTTTA ref RefSeq 

صفحه 32:
* اگر در موتور ‎Entrez‏ منبع 9606 را انتخاب کنید و سپس ژن مورد نظر را جستجو کنید به صفحه ای وارد می شوید. که مربوط به جستجوی اسم ژن شما در منبع 0۶۱۱۴ می باشد می توانید مشاهده کنید که ژن های مربوط با سایر گونه ها و سایر ژن ها با اسامی مشابه نیز اورده شده است. در میان ژن های لیست شده ژن مورد نظر خود را بیابید ( در اینجا گزینه اول که مربوط به انسیان آست) توجه داشته باشید که در اين صفحه برای هر ژن مکان آن برروی کروموزم ها و سایر اسامی همین ژن و توضیح مختصری در مورد آن شده است. برروی ژن مورد نظر خود کلیک کنید . 

صفحه 33:
۱۵8۵۱ NCBI Home Stone 1 Conserved Domains Resource List (AZ) dbGaP Jet for Biotechnology Inforrnation advances science and health by providing acces | ۰۳ ‏سدق‎ USE ee ‏ودع‎ ‎> ‎‘DNA & RNA, GEO DataSets Download Learn Ss cece eae ‏لت داشگ سس‎ 0 178 3 re 2 ‏وس‎ ‏فسات‎ identical Protein Groups ie 5 ‏ب‎ NCBI Web Site thea Kona ١ Proteins ‎Develop Analyze Researct‏ مره وی 

صفحه 34:
۳ Cteate RSS Create slen Advanced Tabular> 20 per page > Sort by Relevance - ‘Send to: See VEU visual system hamanbor | in the Gene database ver! inom canine Mus musculis Rattus nonmgicus All 200 Gene woods Search results Gene ۳ lems: 1 te 20 of 224 Page © See also # diccontinuad ur ‏قلقلا عملم ف‎ NameiGiene 1 ovation Aliases wn Cvs A asuslaystem homectoxT xghromosome 2, ASS, KTON, KENT, PPCD, ‏دده‎ ‏ادن , ع6 )الي الم عمد )3003 نا‎ 1 fastesnan, 25002273, ‏رن‎ ‎Ovex ‘sual system hamesbox t Chomasums 2, cree sors ‏مساق‎ (rouse Ne_cnMna 7 

صفحه 35:
۱ ی ‎homeobox 1 hemoleg, CHAI‏ اوكا ‎RefSeqs maintained! independently of Annotated Genomes‏ 1 ‎ ‎= NCBI Reference ‎ ‎quences (RefB ‎ ‎hese reference sezusrces oust independerily of genome bulds: Explain ‎Genomic ‎ ‎ ‎NG_on8101.2 RerSeqGon. 2 ‎Dowload GenBank FTA Serwencs Vist Graahies) ‎ ‎mRNA ane Proeings) ‎1 -NP_001243700.1 visual system homeobox 1 isoform & frac and their annotated! locadons for NP_O01249200.4 Status: REVIEWED. ‎Deseriion TranscitVaent This aint elifere mtne:7 UTR ang as coding raion, compaved ovata The est (isotomn =) has alist Crm nus ands shorter than sctom 3 ‎ 

صفحه 36:
جستجوی توالی پروتئین 

صفحه 37:
۲۷۴۷2۶۱ |1۲ | 532319 | 1و< ‎TVFV2E envelope protein‏ ‎ELRLRYCAPAGFALLKCNDADYDG‏ ‎FKTNCSNVSVVHCTNLMNTTVTTG‏ ‎LLLNGSYSENRTQIWQKHRTSNDS‏ ‎ALILLNKHYNLTVTCKRPGNKTVL‏ ‎PVTIMAGLVFHSQKYNLRLRQAWC‏ ‎HFPSNWKGAWKEVKEEIVNLPKER‏ ‎YRGTNDPKRIFFQRQWGDPETANL.‏ ‎WFNCHGEFFYCKMDWFLNYLNNLT‏ ‎VDADHNECKNTSGTKSGNKRAPGP‏ ‎CVQRTYVACHIRSVIIWLETISKK‏ ‎TYAPPREGHLECTSTVTGMTVELN‏ ‎YIPKNRTNVTLSPQIESIWAAELD‏ ‎RYKLVEITPIGFAPTEVRRYTGGH‏ ‎ERQKRVPFV‏ One-letter ‘symbol و« و و و وم موم و عم و وم و وب وک Three-letter abbreviation ‘Ala Ang Asn As Asx Cys Gin Glu ca 7 His te ‏سا‎ ‎us ‎Met ‎Pre ‎Pro ‎ser ‎Thr ‎7 vat Abbreviations for amino acids Amino 3c Alonine Adginine Asparagine Aspartic ecid Asparagine or aspartic acid Cysteine Glutamine Glutamic acid Glutamine or glutaric acid Giyeine Histicine Isoloucine Leucine Lysine Methionine Phenylalanine Proline Sorine Threonine ‘Tryptophan Tyrosine Valine 

صفحه 38:
توالی های حفاظت شده در پروتئین ها ‎(Conserved sequences)‏ * دانش فعلی ما از رابطه ساختمان و عملکرد پروتئین ها نشان می دهد که تمام توالی یک پروتئین برای عملکرد آنها لازم نیستند بلکه توالی های خاصی که ساختمان ویژه ایجاد می كنند يا محل هايى كه جایگاه واکنش (516 ‎Binding site) JLasl ol&le L 5 (Catalytic‏ نامیده می شوند, برای فعالیت پروتئین (يا آنزیم) کفایت می کند. اين توالى ها به دلیل اهمیت عملکردی و ساختمانی در طی تکامل حفظ ‎cal oa‏ ته عبارنت:دیگز خهنش در این توالی ها کشنده اننت وادز صورت اتفاق جهش تصادفی در این توالی ها موجودات حامل آن ش ها حذف شده اند و در زمان کنونی وجود ندارند. اینگونه توالی ها توالى هاى حفاظت ‎ue ousoli ( Conserved sequences) ox‏ شوند 

صفحه 39:
* یکی از راههای دسترسی به اطلاعات مربوط به پروتئین ها ورود به پایگاه داده ۱۱8۱ است. «در قاذر مور بيظر ماكاة داده پزوفین را اسحات کرده و در ادر مقابل أن نام زن را وارد مى كنيم. * مانند آنچه در موید توالی نوکلئوتیدی گفتیم مى توانيم جستجو را به طریق مختلف محدود کنیم Protein a ee ‏سس‎ © Fs scat Rea Cos 

صفحه 40:
‘splay Senge + Surwray, 2 per gage Sosy Detar Serie + Fei: nag ee Soo tA euin 1 aban the Gene database ‏سدع‎ by xen 0106 ‏لاص سوسوم ملسا‎ Senso in ace nee ‏و‎ Items: 110 20 0359 ot ny Pm] ‏اس خی‎ 1 لاص ‎ESTA‏ سس سس A patina consis 271 aaproen ‏باضه متف كد لاسن لكيس‎ وم مومت مومت صت هتخت مهس سس #0 وه ره صست فلت تم اس +o ‘Recent setiy anton mil ‏و مره وت سل‎ @ tame mation 6) oo (D ecNane Futsnevuk. aa; Shalt pha Name: FulleHemalopit. 1 F 

صفحه 41:
#ابس ات1 ۲ ‎ills: 1 3‏ مورد نظر همانگونه که مشاهده می شو هر ركورد 3 جالت مختلف نمایش وجود دارد )1 ‎‘ASTA‏ ان ۱ © , غمعممعق 5 271 ga protein 

صفحه 42:
GenPept ‏فرمت‎ * اين فرمت مانند آنچه در مورد توالی نوکلئوتیدی گفتیم سه بخش سرآمد(۲۱۵۵06۲ ), ویژگی (۵۲۲6ع۳) و توالی دارد. * اطلاعات مختلف در مورد بخش ‎slo‏ مختلف توالی در می توان در این بخش ها مشاهده کرد. 

صفحه 43:
“interleuhin'2 alphas pro-interleskin-L-alphes ‏تمه فلا‎ ‏تس از‎ pol esen7e ton ots 0 روم رهنجرمو ارجام تس هچ ات سب چم (rotesimerseuin-a tootoges; Cystine with various ‏لس لسري امس‎ sighed bees aro (onsen rece RS oars co 28888 rderaa, ti, 353 186,358, 250,19,270,211.218,225, Syst a Instestecapear sinaing site [sess cee sini ai ‏ف ا را‎ cca Se Set wattage oncheaoes tae ۱۳ 

صفحه 44:
Send ta. interleukin-1 alpha proprotein [Homo sapiens] و وا وف یت و سيوم يبههربر يه 2 

صفحه 45:
* یعنوان مثال اسید امینه هایی که در جایگاه فعال (506 ۸۱۷۵) آنزیم آلکالن فسفاتاز قرار دارند را می توان در اين بخش مشاهده کرد.