نرم افزارهای مهم درشناسایی miRNA

نرم افزارهای مهم درشناسایی miRNA

اسلاید 1: نرم افزارهای مهم در شناسایی miRNA

اسلاید 2: miRBaseبانک اطلاعاتی   miRBase بانکی قابل جستجو از  توالیهای miRNA منتشر شده و موقعیت یابی شده می باشد. هر ورودی جدید در بانک توالی miRBase نشان دهنده یک قسمت سنجاق سری پیشگویی شده از رونوشت  miRNA (تحت عنوان mir) به همراه اطلاعات مکانی و توالی miRNA بالغ (تحت عنوان miR) می باشد. هر دو توالی سنجاق سری و بالغ جهت جستجو و بررسی قابل دسترس می باشند، ورودیها همچنین می توانند به کمک نام، کلمه کلیدی، منابع و موقعیت ژنومی دستیابی شوند. تمامی اطلاعات مربوط به توالی ها و موقعیت ژنومی آنها نیز قابل دانلود شدن هستند.  

اسلاید 3:

اسلاید 4:

اسلاید 5: نرم افزارهای مهم در شناسایی ژن های هدف miRNA برخی از مهمترین و کاربردی ترین این نرم افزارها MFold ، RNAhybrid ، TargrtScan، DIANA-MicroT ، miRanda PicTar و miRWalk هستند که در بسیاری از مطالعات انجام گرفته مورد استفاده قرار گرفته اند. 

اسلاید 6: TargetScan در Target scan ابتدا جفت شدگی کامل برای ناحیه seed جستجو و سپس به نواحی اطراف بسط داده می‌شود.