صفحه 1:
نرم افزارهای مهم در شناسایی ۱۱۴۱۱۵
صفحه 2:
miRBase
بانک اطلاعاتی 7۱18856 بانکی قابل جستجو از
توالیهای ۲۳۱۴۷۸۵ منتشر شده و موقعیت یابی شده می
باشد. هر ورودی جدید در بانک توالی ۲۱۱۴۸8۵56 نشان
دهنده یک قسمت سنجاق سری پیشگویی شده از
رونوشت ۲۱۱۴۱۷۵ (تحت عنوان ۲۱[۲) به همراه اطلاعات
مکانی و توالی ۳08۱۷۸ بالغ (تحت عنوان wubb Go (MIR
هر دو توالی سنجاق سری و بالغ جهت جستجو و بررسی
قابل دسترس می باشند, ورودیها همچنین می توانند به
کمک نام, کلمه کلیدی, منابع و موقعیت ژنومی دستیابی
شوند. تمامی اطلاعات مربوط به توالی ها و موقعیت
ژنومی آنها نیز قابل دانلود شدن هستند.
صفحه 3:
MANCH
[Micokwa Gene ontology annotations ys une 7, 208)]
sane lan bl erect سي سوس fey eC
[cape ip mbare regbnmatr tre تجن لانن مالا يد ean len msrp?
Insture_ace=MIMaTootone the new sion 19/36۵ سس cata set of igh quay nl sme
[cone omelny nme formar mane teva ary oF hen cone em the sro ache ney et
ed
Imisuase 22 release sam (arch 12,208)
tox eat ne wneasnsla clay, mae 2 i fay released you mg expect th sch along om
اما مها of seqencesin te dataace hs jp ری وه by oer 3. Th vax map of e
nm no mas anyon spaces ot revs graeme inte ena na there يس
| Relnase 22: March 2018
(Go [Exon
Download pace | FTP ste
miRBase: the microRNA database
‘miRBase provides the following services
‘+ The mBBase datatiase Is a searchable database of published miRNA sequences and annotation. Each entry In the miRBase Sequence
database represents 6 predicted hakpin potion of @ miRNA transcrip (termed mir In the database), with infomation onthe location
{and sequence ofthe mature miRNA sequence (termed mi). Both haipin and mature sequences are avaiable for searching and
browsing, and enries can also be retrieved by name, keyword, references and annotation. All sequence and ennotation data are also
‘avalale for dovnload.
‘The mBBsse Registry provides miRNA gene hunters with unique names for novel miRNA genes prior to publcation of results, Vist the
fale pages for more information about the naming service,
To recelve ema notification of data updates and feature changes please subscribe ta the miBase announcements malig ist Any queries
‘about the website or naming sarvice should be diected at michasetmanchesteac.uk
صفحه 4:
miRBase
non00273 chang: bo)
0
caste امد
و ]
COS "0000007; 182
ادج سر
تست ۱
‘5142313 reads, 76203 ead pero, 107 expetinets
PRR onotatin onaaencs: hgh
جع De you bline Bis MANA rea? |e (36) |Ro(9 | Leone |
صفحه 5:
4لا5 أ نرم افزارهای مهم در شناسایی ژن های هدف
* برخی از مهمترین و کاربردی ترین این نرم
افزارها ۲۵۲9۲۲56۵0 ۰ ۳5۱۱۵۲۱۷۵۲۱۵ ۰ ۷۳۵۱۵,
g DIANA-MicroT . miRanda PicTar °
سهستند که در بسیاری از مطالعات
انجام گرفته مورد استفاده قرار گرفته اند.
صفحه 6:
TargetScan
٠ در 5627 13۲961 ابتدا جفت شدگی کامل
براى ناحيه 0 جستجو و سپس به نواحی
اطرا
Geargetscantuman 5
Search for predicted microRNA targets In ma
ی
و رماع مسموب ر یط
صفحه 7:
سس موعخاعونه6)
Human GATAA 3" UTR
‘predicted pairing
ا ل سا
صفحه 8:
pictar
* اين الگوریتم یک گروه از اورتولوگ های
UTR*3 از گونههای مختلف را به عنوان داده
ورودی در نظر میگیرد و آنهایی را انتخاب
میکند که جفت شدگی ناحیه 5660 با
۸۵ را نشان دهند و سپس از لحاظ
ترمودینامیکی فیلتر شده و بر اساس روش .
امتیاز بندی میشود. ۱۷۵۲ اولین نرم افزاری
بود که از ویژگی هم بیانی زمانی و مکانی
۷۸ و هدفش استفاده میکند.
صفحه 9:
‘Choose Species | سس
‘Choose Dataset | tye peicon or al human mioasbasedonconanaton h mammal an,
27
frizedkt اس
تست SIGS | vertebrates! use RefSeq identifiers, «12, NM_003483 or Gene symbols (for exaraple HK2),
‘Search fr argels ofa mRNA | Soaich or a miRNAs predicted. target a Gone | Search for Tsu |rosst |
صفحه 10:
۱
* اين نرم افزار طویلترین جفت شدگی ها را بین توالی ژن و MIRNA
مشخص میکند. ابتدا کل توالی ژن و توالی میتوکندریایی را بر اساس
هپتامر ناحیه 5660 و ۲۱8۱۷۵ بررسی و نواحی اتصالی ممکن را بر
اساس بلندترین جفت شدگی انتخاب میکند؛ و سپس نواحی پیدا
شده را بر اساس اینکه پروموتر, 5 "605 ,۲8لا يا 183لا باشد
بررسی میکند.
۰ همچنین این نرم افزار نتایج به دست آمده را با هشت نرم افزار دیگر
Diana-microt. Miranda. miRDB, Pictar. PITA. Joli
۵ ,۳۸۱۵۸22 و ۲۵۳9615620 مقایسه و نتایج به صورت یک
جدول به نمایش گذاشته میشود.
* به طور کلی میتوان گفت روشهایی که مبنای عمل آنها" به صورت
ترکیبی از الگوزیتمهای مختلف است" دید کلنتری را در مورد احتمال
هدف بودن ناحیه مورد مطالعه در اختیار ما قرار میدهند.
صفحه 11:
۱
News and Updates: New version of miRWalk
+ fect peat pts CuRE EY ممصم عون مدب سوم مده سي se
2 eta Te ow vnc mn Ss pee an ties
+ Agate: an so pan scant, Soa ms aan iy eee ee
ل ‘ero en nr ops ne se Oe
+ Rove satan Corot aneoraa Tat etn mtr pote ean
+ Soc ip. rum pent - امدعة تريح عن ماين
7 یمس درو Ono pees Cs
سس
Search for a single gene or miRNA,
ahs: inane رمك جاو موه وما Access me MAATOIEZT) ed on cit MAGE seg eg RNA
تدج ديام be abn Me ie میات ار مه سل له ما ده مد یی رس وله ام سس
ASD, meas (e “ate Ensembe eg ENSGIOND eH of ENSTOCODISE) no ReSeaDs eM ON S390 wee ees ]
صفحه 12:
PDK1
هامریت
aise
Desenpton_ Hono هه مساو وود ماو وه (POM) ranscpt aan, MRNA
رس میس ama
صفحه 13:
miRTarBase
Accession 1D: MIRT032356 [miRNA, f192-ict-7b-5p : PDK’, target gene]
miRNA | TargetGene | Evidences | Expression | TCGA | GeneSet nrichments | Network | ERROR Report
pre-mRNA Information
pre-miRNA ID hsa-lot7b LinkOut: [ mIRBase }
رو LETTB, MIRNLETTB, و تماق 8
Homo sapions fet-7b stem-loop
None
صفحه 14:
miR2Disease
* از آنجایی که ۲۱۱۷۵۸ در عملکرد طبیعی سلول
sla یوکارپوتی دخیل است, بر هم خوردن
تنظیمات آن منجر به بروز بیماری می شود.
۶ جهش در ۲69100 5660 اين مولکول های
تنظیمی و يا حذف دسته ای از آنها می تواند
منجر به بروز نواقص ژنتیکی شود.
۶ در پایگاه اطلاعاتی ۲۱۱82056856 ارتباطات
میان اختلال در تنظیم ۲۱۱۴۱۱۸۵ ها و بیماریهای
صفحه 15:
ی سس و
سس ب |
tome = Introdaction Statice
صفحه 16:
(201 5 INDIANA UNIVERSITY
© ممدعاقتهه ابر ريه
| 0
0
۰ میک« تنم
HOME
Users can search all entries in three ways: by miRNA ID, by disease name or exoerimentally
ANALYSIS
ممعت مم بت
Bp fated target gene(s) extracted rom the orginal reference and target +
(gene(s) rectly darivad from Iarbas
Search by miRNA ID pe )
۹۵
Search by disease name 15
ae . Search by target gene (WW)
miRNAMap 2.0
