بررسی نشانگر مولکولی SNP و کاربرد آن در به نژادی
اسلاید 1: دانشکده کشاورزي گروه آموزشي زراعت و اصلاح نباتات وکاربرد آن در به نژادی SNPبررسی نشانگر مولکولي استاد:ارائه: دی ماه 13981
اسلاید 2: مقدمه:نشانگر ملکولی به منظور کسب اطلاعات در مورد ژنتیک صفات استفاده میشود. نقش نشانگرهای ملکولی در تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک بسیار شناخته شده است و ابعاد جدیدی را برای نظریات تکاملی در تحقیقات گیاهی و جانوری به ارمغان می آورد.در مطالعات مربوط به ژنوم گیاه معمولا از نشانگرهای زیر استفاده میشود:RFLP، CAPS، STS، RAPD، SCAR، AFLP، SSAP، SSR، ISSRاین نشانگرها بر اساس هدف استفاده، نوع چند شکل و روش اصلی که برای تجزیه و تحلیل استفاده میشود، در گروههای مختلف طبقهبندی میشوند. گوپتا و همکاران طبقه بندی گسترده ای از نشانگرهای DNA را ارائه داده اند ، که براساس آن ، آنها به سه طبقه تقسیم می شوند:1) نشانگرهای DNA مبتنی بر هیبریداسیون مانند RFLP 2) نشانگرهای DNA مبتنی بر PCR به عنوان مثال CAPS ، STS ، RAPD ، SCAR ، AFLP ، SSAP ، SSR ، ISSR3) نشانگرهای DNA مبتنی بر توالی (SNP).2
اسلاید 3: 3
اسلاید 4: واژه نشانگر معمولاً برای لوکوس به کار میرود و نشانگرهای ژنتیکی مکانهایی بر روی کروموزومها هستند که در آنالیز و مطالعه ژنوم موجودات مورد استفاده قرار میگیرند.آن چه منبع تنوع ژنتیکی میباشد اختلاف بین توالی DNA و کروموزومهای دو فرد است، این اختلاف در توالی DNA را میتوان به وسیله روشهای مختلفی مشخص نمود. برخی اختلافات فنوتیپی با چشم قابل رویت هستند که با بررسی آنها میتوان به میزان تنوع پی برد، برخی اختلافات فنوتیپی نیازمند روشهای پیچیدهتری برای مشخص نمودن آنها میباشد، بعضی با بررسی پروتئینها و انزیمها از بافتهای مختلف و بعضی را با مطالعه کروموزومها میتوان آنالیز نمود. بعضی از اختلافات در توالی، در نقاطی ازDNA میباشند که جزء نواحی کد کننده نمیباشند و فنوتیپ ظهور پیدا نمیکنند، این دسته از تغییرات را باید با آنالیز مستقیم DNA شناسایی نمود. بنابر این نشانگر های ژنتیکی خود به انواع مختلفی تقسیم میشوند از جمله: نشانگر های مورفولوژیکی، نشانگر های سیتولوژیکی و نشانگرهای مولکولی . یک SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) تفاوت یافت شده در یک نوکلئوتید نسبت به موقعیت مشابه آن در توالی DNA است. گاهی اوقات یک جهش منجر به چند شکلی تک نوکلئوتیدی(SNP) بین دو یا چند توالی DNA می شوند.این تنوع، تنها شامل یک باز می باشد و به صورت تصادفی به ازای هر 300-200 باز در ژنوم دیده می شود.SNPها به عنوان یک منبع ژنتیکی عمده ازتغییرفنوتیپی درون یک گونه در نظر گرفته می شوند و به عنوان مارکر ژنتیکی قابل اعتماد و کارا به حساب می آیند. SNPها در شناسایی ژن هایی که در بیماری و صفات فنوتیپی نقش دارند مفید هستند و می توانند به عنوان نشانگر ژنتیکی برای تهیه نقشه های ژنتیکی با تراکم بالا ( بالا ترین وضوح نقشه را ارئه می دهد) و مطالعات مربوط به بیماری ها مورد استفاده قرار گیرند. SNP ها به دلیل تکرار پذیری بالا، انتقال وراثت بالا و توان عملیاتی بالا به جای روش های قدیمیSSR,AFLP,RFLP برای نقشه برداری استفاده می شود.4
اسلاید 5: از جمله موتاسیون های ایجاد کننده SNPها میتوان به جایگزینی باز های پورین(A/G) یا پیریمیدین(T/C) به همدیگر اشاره کرد که جهش هم جنس(Transition) نامیده می شود.نوع دیگری از جهش ها که ایجاد کننده SNPها می باشد جایگزینی باز پورین با پیریمیدین یا پیریمیدین با پورین می باشد که جهش غیر هم جنس(Transversion) نامیده می شود.انتخاب روش مناسب جهت شناسایی این جهش ها بسیار حائز اهمیت می باشد.SNPعوامل ایجاد کننده 5
اسلاید 6: 6
نقد و بررسی ها
هیچ نظری برای این پاورپوینت نوشته نشده است.